Bioinformatics with R Cookbook

Книга «Bioinformatics with R Cookbook» представляет собой сборник из более чем 90 практических рецептов, предназначенных для вычислительных биологов, которые хотят моделировать и обрабатывать реальные биологические данные с использованием языка R. Автор, Пауруш Правен Синха, имеющий многолетний опыт работы с R в области биоинформатики и машинного обучения, делится проверенными подходами к решению типовых задач анализа биологических данных.

Издание охватывает широкий спектр тем: от базовой обработки последовательностей ДНК и РНК до статистического анализа и визуализации данных. Каждый рецепт содержит пошаговые инструкции, примеры кода и объяснение результатов, что позволяет читателям быстро применять полученные знания на практике. Книга ориентирована на специалистов, уже знакомых с основами R, но желающих углубить свои знания в области биоинформатики.

Основное внимание уделяется практическим аспектам работы с биологическими данными: чтение и запись файлов различных форматов (FASTA, FASTQ, VCF), манипуляции с последовательностями, аннотация генов, анализ экспрессии, работа с базами данных биологической информации. Также рассматриваются методы машинного обучения для классификации и кластеризации биологических данных.

Книга будет полезна как исследователям, так и студентам биологических и медицинских специальностей, которые хотят использовать R для анализа данных. Она также может служить справочником для опытных пользователей, ищущих готовые решения для конкретных задач биоинформатики.